胃镜检查是将前端装有内镜的细长管子，从患者口腔插入后，依次观察食管、胃、十二指肠的一部分。
检查过程中，医生会重点观察，例如幽门及胃窦部、胃角切迹，胃体、贲门及胃底部这些病变好发部位。
如未发现异常，医生会将内镜后退，再次回到胃底，应用旋转镜身，屈曲镜端以及倒转镜身等方法，对胃体部和胃底部进行全面观察。
如发现异常，医生会用安装在内镜顶部的照相机，拍摄病变，必要时使用活检钳采集少量组织后，送到病理科进行检查。病理科对采集的组织标本染色后，在显微镜下观察，大约在一周后可以出示检查报告。

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