肿瘤标记物有相当的临床参考意义，部分肿瘤的肿瘤标志物意义极大。如肝癌的甲胎蛋白，前列腺癌的PSA，前列腺特异性抗原，对于这两种肿瘤有相当大的意义。部分疾病的肿瘤标志物也有很大参考意义，如癌胚抗原，对于胃肠道、肺癌以及妇科肿瘤都有一定的指导意义。若发现肿瘤标志物升高一定要进行相应检查，如肺部的CT，胃肠道镜检以及妇科的检查等。
肿瘤标志物要动态观察，若它在逐渐升高要高度警惕，特别是有肿瘤病史的病人。若找不到实体病灶，可以做PET-CT进行全身的检查，加以明确。

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