潜伏期尖锐湿疣可以痊愈。一般从感染HPV病毒到出现肉眼可见的疣状皮损，需要3~8个月左右的潜伏期，在这一段时间内称为潜伏期的尖锐湿疣，一般肉眼不可见，所以可以通过一些辅助手段，比如做醋酸白试验或HPV病毒的基因检测发现病毒。
如果发现病毒，可以采取一些药物治疗，比如局部外用干扰素凝胶或者咪喹莫特乳膏等抗病毒药物。另外，也可以考虑采取光动力疗法。
有时候不采取药物治疗，体内潜伏的HPV病毒，在机体免疫功能正常的情况下也可以被自行清除，而不发展成尖锐湿疣。

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